Nota Fiscal Eletrônica para Médicos em São Paulo: Guia Completo 2026

A emissão de nota fiscal de serviços médicos em São Paulo é obrigatória para qualquer prestação de serviço, seja para pessoa física (paciente particular) ou pessoa jurídica (hospital, operadora de plano de saúde ou empresa). O não cumprimento sujeita o profissional a multa de 50% do ISS devido.

NFS-e para Médico Autônomo em SP

O médico autônomo (pessoa física) em São Paulo emite NFS-e pelo portal da Prefeitura de SP (nota.prefeitura.sp.gov.br). O ISS para médicos autônomos em SP é cobrado de forma fixa (ISS Fixo), que varia de R$ 50 a R$ 150/mês dependendo da especialidade — muito mais vantajoso que os 5% sobre o faturamento.

NFS-e para Empresa Médica (PJ)

A empresa médica emite NFS-e pelo mesmo portal, mas o ISS é calculado sobre o faturamento (2% a 5%). No Simples Nacional, o ISS já está incluso no DAS. Para empresas no Lucro Presumido, o ISS é recolhido separadamente à Prefeitura de SP.

CNAE Correto para Emissão de Nota Fiscal Médica

• Clínica médica geral: 8630-5/01
• Clínica médica especializada: 8630-5/02
• Médico autônomo: 8630-5/99
• Telemedicina / consulta remota: 8630-5/99

Retenção de ISS pelo Tomador de Serviço

Hospitais, laboratórios e operadoras de planos de saúde frequentemente retêm o ISS na fonte ao pagar o médico autônomo. Essa retenção deve ser declarada mensalmente pelo profissional para evitar dupla tributação.